Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC26A3P40879 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC26A3P40879 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC26A3P40879 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC26A3P40879 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC26A3P40879 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC26A3P40879 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC26A3P40879 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC26A3P40879 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC26A3P40879 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC26A3P40879 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC26A3P40879 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC26A3P40879 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC26A3P40879 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC26A3P40879 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SLC26A3P40879 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC26A3P40879 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SLC26A3P40879 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SLC26A3P40879 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SLC26A3P40879 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SLC26A3P40879 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A3P40879 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SLC26A3P40879 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SLC26A3P40879 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC26A3P40879 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SLC26A3P40879 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC26A3P40879 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC26A3P40879 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC26A3P40879 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC26A3P40879 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC26A3P40879 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC26A3P40879 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SLC26A3P40879 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC26A3P40879 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC26A3P40879 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC26A3P40879 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC26A3P40879 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A3P40879 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC26A3P40879 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC26A3P40879 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC26A3P40879 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SLC26A3P40879 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC26A3P40879 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC26A3P40879 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC26A3P40879 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SLC26A3P40879 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SLC26A3P40879 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC26A3P40879 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC26A3P40879 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC26A3P40879 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC26A3P40879 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC26A3P40879 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC26A3P40879 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC26A3P40879 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC26A3P40879 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC26A3P40879 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A3P40879 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A3P40879 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A3P40879 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC26A3P40879 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC26A3P40879 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SLC26A3P40879 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC26A3P40879 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC26A3P40879 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC26A3P40879 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLC26A3P40879 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC26A3P40879 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC26A3P40879 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC26A3P40879 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms