Protein–RNA interactions for Protein: P38358

VBA2, Vacuolar basic amino acid transporter 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VBA2P38358 YBR220CYBR220C 1683 nt11.02□□□□□ -0.64
VBA2P38358 YOL037CYOL037C 354 nt11□□□□□ -0.65
VBA2P38358 BDF1YLR399C 2061 nt10.99□□□□□ -0.65
VBA2P38358 ART5YGR068C 1761 nt10.98□□□□□ -0.65
VBA2P38358 SDH1YKL148C 1923 nt10.98□□□□□ -0.65
VBA2P38358 PET9YBL030C 957 nt10.97□□□□□ -0.65
VBA2P38358 YCH1YGR203W 447 nt10.96□□□□□ -0.65
VBA2P38358 GFD2YCL036W 1701 nt10.95□□□□□ -0.66
VBA2P38358 IRC15YPL017C 1500 nt10.94□□□□□ -0.66
VBA2P38358 NPL3YDR432W 1245 nt10.92□□□□□ -0.66
VBA2P38358 SCC4YER147C 1875 nt10.89□□□□□ -0.67
VBA2P38358 YOR139CYOR139C 393 nt10.89□□□□□ -0.67
VBA2P38358 TIR4YOR009W 1464 nt10.88□□□□□ -0.67
VBA2P38358 GIS3YLR094C 1509 nt10.87□□□□□ -0.67
VBA2P38358 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.86□□□□□ -0.67
VBA2P38358 TAT1YBR069C 1860 nt10.86□□□□□ -0.67
VBA2P38358 RTS2YOR077W 699 nt10.84□□□□□ -0.67
VBA2P38358 YJL152WYJL152W 360 nt10.82□□□□□ -0.68
VBA2P38358 YMR057CYMR057C 372 nt10.81□□□□□ -0.68
VBA2P38358 CUE1YMR264W 612 nt10.79□□□□□ -0.68
VBA2P38358 WHI5YOR083W 888 nt10.74□□□□□ -0.69
VBA2P38358 SEC11YIR022W 504 nt10.73□□□□□ -0.69
VBA2P38358 YLR281CYLR281C 468 nt10.73□□□□□ -0.69
VBA2P38358 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.7□□□□□ -0.7
VBA2P38358 YIL100WYIL100W 354 nt10.69□□□□□ -0.7
VBA2P38358 YLR236CYLR236C 324 nt10.68□□□□□ -0.7
VBA2P38358 FPS1YLL043W 2010 nt10.67□□□□□ -0.7
VBA2P38358 YNL195CYNL195C 786 nt10.64□□□□□ -0.71
VBA2P38358 PCH2YBR186W 1695 nt10.63□□□□□ -0.71
VBA2P38358 YSC84YHR016C 1407 nt10.63□□□□□ -0.71
VBA2P38358 IDH1YNL037C 1083 nt10.58□□□□□ -0.72
VBA2P38358 IMP2'YIL154C 1041 nt10.57□□□□□ -0.72
VBA2P38358 GUT2YIL155C 1950 nt10.56□□□□□ -0.72
VBA2P38358 PUS2YGL063W 1113 nt10.56□□□□□ -0.72
VBA2P38358 RRT12YCR045C 1476 nt10.55□□□□□ -0.72
VBA2P38358 YHL050CYHL050C 2094 nt10.54□□□□□ -0.72
VBA2P38358 YJL225CYJL225C 5277 nt10.52□□□□□ -0.73
VBA2P38358 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.51□□□□□ -0.73
VBA2P38358 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.51□□□□□ -0.73
VBA2P38358 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.51□□□□□ -0.73
VBA2P38358 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.51□□□□□ -0.73
VBA2P38358 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.51□□□□□ -0.73
VBA2P38358 GBP2YCL011C 1284 nt10.51□□□□□ -0.73
VBA2P38358 DSK2YMR276W 1122 nt10.49□□□□□ -0.73
VBA2P38358 TCD2YKL027W 1344 nt10.43□□□□□ -0.74
VBA2P38358 RRD1YIL153W 1182 nt10.41□□□□□ -0.74
VBA2P38358 FMP52YER004W 696 nt10.39□□□□□ -0.75
VBA2P38358 RTF1YGL244W 1677 nt10.38□□□□□ -0.75
VBA2P38358 BOP3YNL042W 1191 nt10.38□□□□□ -0.75
VBA2P38358 YDR433WYDR433W 441 nt10.37□□□□□ -0.75
VBA2P38358 YPR011CYPR011C 981 nt10.34□□□□□ -0.75
VBA2P38358 PIB2YGL023C 1908 nt10.34□□□□□ -0.75
VBA2P38358 PAC11YDR488C 1602 nt10.33□□□□□ -0.76
VBA2P38358 DED1YOR204W 1815 nt10.33□□□□□ -0.76
VBA2P38358 FMP45YDL222C 930 nt10.32□□□□□ -0.76
VBA2P38358 ERV46YAL042W 1248 nt10.29□□□□□ -0.76
VBA2P38358 PCM1YEL058W 1674 nt10.26□□□□□ -0.77
VBA2P38358 YKR040CYKR040C 504 nt10.26□□□□□ -0.77
VBA2P38358 FMT1YBL013W 1206 nt10.26□□□□□ -0.77
VBA2P38358 MXR2YCL033C 507 nt10.26□□□□□ -0.77
VBA2P38358 LPX1YOR084W 1164 nt10.24□□□□□ -0.77
VBA2P38358 NCP1YHR042W 2076 nt10.23□□□□□ -0.77
VBA2P38358 CWP1YKL096W 720 nt10.22□□□□□ -0.77
VBA2P38358 YCL042WYCL042W 360 nt10.22□□□□□ -0.77
VBA2P38358 SOR2YDL246C 1074 nt10.2□□□□□ -0.78
VBA2P38358 SOR1YJR159W 1074 nt10.2□□□□□ -0.78
VBA2P38358 LCB1YMR296C 1677 nt10.2□□□□□ -0.78
VBA2P38358 ADH2YMR303C 1047 nt10.2□□□□□ -0.78
VBA2P38358 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.19□□□□□ -0.78
VBA2P38358 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.19□□□□□ -0.78
VBA2P38358 SIM1YIL123W 1431 nt10.19□□□□□ -0.78
VBA2P38358 SNF6YHL025W 999 nt10.19□□□□□ -0.78
VBA2P38358 PTK1YKL198C 1989 nt10.19□□□□□ -0.78
VBA2P38358 FRD1YEL047C 1413 nt10.12□□□□□ -0.79
VBA2P38358 BIO4YNR057C 714 nt10.1□□□□□ -0.79
VBA2P38358 YIH1YCR059C 777 nt10.06□□□□□ -0.8
VBA2P38358 NVJ2YPR091C 2313 nt10.05□□□□□ -0.8
VBA2P38358 RNQ1YCL028W 1218 nt10.05□□□□□ -0.8
VBA2P38358 YFL054CYFL054C 1941 nt10.05□□□□□ -0.8
VBA2P38358 ERF2YLR246W 1080 nt10.02□□□□□ -0.81
VBA2P38358 YLL053CYLL053C 459 nt9.99□□□□□ -0.81
VBA2P38358 LYS4YDR234W 2082 nt9.98□□□□□ -0.81
VBA2P38358 DIC1YLR348C 897 nt9.96□□□□□ -0.82
VBA2P38358 SPT8YLR055C 1809 nt9.94□□□□□ -0.82
VBA2P38358 CRR1YLR213C 1269 nt9.94□□□□□ -0.82
VBA2P38358 YLR235CYLR235C 399 nt9.93□□□□□ -0.82
VBA2P38358 SPP1YPL138C 1062 nt9.93□□□□□ -0.82
VBA2P38358 FTR1YER145C 1215 nt9.92□□□□□ -0.82
VBA2P38358 YFL067WYFL067W 528 nt9.91□□□□□ -0.82
VBA2P38358 PTH1YHR189W 573 nt9.9□□□□□ -0.82
VBA2P38358 ATF2YGR177C 1608 nt9.87□□□□□ -0.83
VBA2P38358 HEM12YDR047W 1089 nt9.87□□□□□ -0.83
VBA2P38358 DDR2YOL052C-A 186 nt9.87□□□□□ -0.83
VBA2P38358 GAL1YBR020W 1587 nt9.87□□□□□ -0.83
VBA2P38358 AQY1YPR192W 918 nt9.86□□□□□ -0.83
VBA2P38358 TRM5YHR070W 1500 nt9.85□□□□□ -0.83
VBA2P38358 TIM23YNR017W 669 nt9.84□□□□□ -0.83
VBA2P38358 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.81□□□□□ -0.84
VBA2P38358 YKL030WYKL030W 606 nt9.81□□□□□ -0.84
VBA2P38358 SNG1YGR197C 1644 nt9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.6 ms