Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGER4P35408 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER4P35408 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGER4P35408 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER4P35408 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTGER4P35408 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTGER4P35408 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGER4P35408 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGER4P35408 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTGER4P35408 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGER4P35408 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGER4P35408 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER4P35408 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGER4P35408 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGER4P35408 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGER4P35408 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER4P35408 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGER4P35408 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGER4P35408 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGER4P35408 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGER4P35408 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGER4P35408 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGER4P35408 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGER4P35408 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGER4P35408 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGER4P35408 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGER4P35408 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGER4P35408 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGER4P35408 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGER4P35408 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGER4P35408 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGER4P35408 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTGER4P35408 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER4P35408 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGER4P35408 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGER4P35408 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGER4P35408 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGER4P35408 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGER4P35408 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTGER4P35408 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGER4P35408 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGER4P35408 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGER4P35408 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGER4P35408 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGER4P35408 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER4P35408 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER4P35408 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGER4P35408 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGER4P35408 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGER4P35408 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGER4P35408 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGER4P35408 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTGER4P35408 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGER4P35408 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGER4P35408 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTGER4P35408 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTGER4P35408 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PTGER4P35408 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER4P35408 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTGER4P35408 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER4P35408 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTGER4P35408 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTGER4P35408 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTGER4P35408 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTGER4P35408 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER4P35408 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTGER4P35408 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms