Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PTGS2P35354 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTGS2P35354 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTGS2P35354 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTGS2P35354 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTGS2P35354 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PTGS2P35354 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTGS2P35354 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS2P35354 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS2P35354 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGS2P35354 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGS2P35354 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGS2P35354 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTGS2P35354 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTGS2P35354 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTGS2P35354 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTGS2P35354 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTGS2P35354 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTGS2P35354 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms