Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RDXP35241 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RDXP35241 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RDXP35241 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RDXP35241 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RDXP35241 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RDXP35241 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RDXP35241 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RDXP35241 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RDXP35241 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RDXP35241 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RDXP35241 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RDXP35241 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RDXP35241 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RDXP35241 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RDXP35241 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RDXP35241 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RDXP35241 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RDXP35241 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RDXP35241 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RDXP35241 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RDXP35241 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RDXP35241 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RDXP35241 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RDXP35241 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RDXP35241 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RDXP35241 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RDXP35241 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RDXP35241 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RDXP35241 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RDXP35241 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RDXP35241 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RDXP35241 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
RDXP35241 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RDXP35241 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RDXP35241 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RDXP35241 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RDXP35241 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RDXP35241 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RDXP35241 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RDXP35241 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RDXP35241 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RDXP35241 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RDXP35241 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RDXP35241 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RDXP35241 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RDXP35241 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RDXP35241 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RDXP35241 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RDXP35241 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RDXP35241 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RDXP35241 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RDXP35241 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RDXP35241 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RDXP35241 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RDXP35241 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RDXP35241 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RDXP35241 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RDXP35241 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RDXP35241 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RDXP35241 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RDXP35241 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RDXP35241 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RDXP35241 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RDXP35241 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RDXP35241 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RDXP35241 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RDXP35241 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RDXP35241 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RDXP35241 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RDXP35241 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RDXP35241 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RDXP35241 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RDXP35241 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RDXP35241 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RDXP35241 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RDXP35241 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RDXP35241 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RDXP35241 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RDXP35241 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RDXP35241 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RDXP35241 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RDXP35241 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RDXP35241 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RDXP35241 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RDXP35241 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RDXP35241 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RDXP35241 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RDXP35241 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RDXP35241 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RDXP35241 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RDXP35241 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RDXP35241 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RDXP35241 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RDXP35241 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RDXP35241 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RDXP35241 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RDXP35241 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RDXP35241 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RDXP35241 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms