Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFNA8P32881 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFNA8P32881 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFNA8P32881 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFNA8P32881 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
IFNA8P32881 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IFNA8P32881 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IFNA8P32881 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
IFNA8P32881 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IFNA8P32881 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
IFNA8P32881 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
IFNA8P32881 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
IFNA8P32881 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNA8P32881 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
IFNA8P32881 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IFNA8P32881 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNA8P32881 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
IFNA8P32881 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
IFNA8P32881 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
IFNA8P32881 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFNA8P32881 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFNA8P32881 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
IFNA8P32881 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
IFNA8P32881 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
IFNA8P32881 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IFNA8P32881 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
IFNA8P32881 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNA8P32881 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
IFNA8P32881 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IFNA8P32881 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IFNA8P32881 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNA8P32881 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IFNA8P32881 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNA8P32881 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IFNA8P32881 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNA8P32881 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IFNA8P32881 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IFNA8P32881 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
IFNA8P32881 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNA8P32881 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IFNA8P32881 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IFNA8P32881 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
IFNA8P32881 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
IFNA8P32881 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
IFNA8P32881 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IFNA8P32881 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFNA8P32881 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms