Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HLA-DMAP28067 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DMAP28067 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DMAP28067 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DMAP28067 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DMAP28067 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DMAP28067 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DMAP28067 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DMAP28067 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DMAP28067 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HLA-DMAP28067 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DMAP28067 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DMAP28067 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DMAP28067 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DMAP28067 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DMAP28067 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HLA-DMAP28067 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DMAP28067 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DMAP28067 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HLA-DMAP28067 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DMAP28067 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DMAP28067 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DMAP28067 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DMAP28067 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DMAP28067 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DMAP28067 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DMAP28067 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DMAP28067 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DMAP28067 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DMAP28067 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DMAP28067 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-DMAP28067 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DMAP28067 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DMAP28067 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-DMAP28067 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-DMAP28067 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DMAP28067 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DMAP28067 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DMAP28067 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DMAP28067 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DMAP28067 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DMAP28067 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DMAP28067 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HLA-DMAP28067 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DMAP28067 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DMAP28067 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DMAP28067 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DMAP28067 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DMAP28067 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DMAP28067 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DMAP28067 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DMAP28067 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-DMAP28067 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DMAP28067 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DMAP28067 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DMAP28067 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DMAP28067 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DMAP28067 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DMAP28067 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DMAP28067 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DMAP28067 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DMAP28067 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DMAP28067 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DMAP28067 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DMAP28067 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DMAP28067 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms