Protein–RNA interactions for Protein: P23771

GATA3, Trans-acting T-cell-specific transcription factor GATA-3, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA3P23771 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATA3P23771 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATA3P23771 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GATA3P23771 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GATA3P23771 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GATA3P23771 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GATA3P23771 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GATA3P23771 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GATA3P23771 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA3P23771 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GATA3P23771 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GATA3P23771 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GATA3P23771 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GATA3P23771 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA3P23771 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA3P23771 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GATA3P23771 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GATA3P23771 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GATA3P23771 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA3P23771 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GATA3P23771 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GATA3P23771 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA3P23771 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GATA3P23771 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GATA3P23771 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GATA3P23771 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATA3P23771 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATA3P23771 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GATA3P23771 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATA3P23771 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATA3P23771 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA3P23771 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATA3P23771 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GATA3P23771 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATA3P23771 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA3P23771 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GATA3P23771 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GATA3P23771 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GATA3P23771 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GATA3P23771 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA3P23771 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GATA3P23771 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GATA3P23771 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GATA3P23771 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA3P23771 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA3P23771 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA3P23771 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GATA3P23771 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GATA3P23771 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GATA3P23771 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA3P23771 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GATA3P23771 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA3P23771 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GATA3P23771 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GATA3P23771 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GATA3P23771 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA3P23771 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA3P23771 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GATA3P23771 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA3P23771 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GATA3P23771 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GATA3P23771 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATA3P23771 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATA3P23771 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATA3P23771 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA3P23771 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA3P23771 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA3P23771 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATA3P23771 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA3P23771 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GATA3P23771 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATA3P23771 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATA3P23771 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATA3P23771 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATA3P23771 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATA3P23771 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATA3P23771 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATA3P23771 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATA3P23771 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA3P23771 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATA3P23771 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA3P23771 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATA3P23771 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA3P23771 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATA3P23771 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATA3P23771 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA3P23771 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA3P23771 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA3P23771 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GATA3P23771 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATA3P23771 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATA3P23771 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA3P23771 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATA3P23771 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATA3P23771 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA3P23771 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATA3P23771 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA3P23771 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA3P23771 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATA3P23771 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms