Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RPS6KB1P23443 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
RPS6KB1P23443 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
RPS6KB1P23443 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPS6KB1P23443 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RPS6KB1P23443 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
RPS6KB1P23443 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RPS6KB1P23443 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RPS6KB1P23443 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPS6KB1P23443 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPS6KB1P23443 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPS6KB1P23443 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPS6KB1P23443 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPS6KB1P23443 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPS6KB1P23443 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RPS6KB1P23443 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPS6KB1P23443 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPS6KB1P23443 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPS6KB1P23443 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPS6KB1P23443 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPS6KB1P23443 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RPS6KB1P23443 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RPS6KB1P23443 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
RPS6KB1P23443 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KB1P23443 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RPS6KB1P23443 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
RPS6KB1P23443 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPS6KB1P23443 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPS6KB1P23443 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
RPS6KB1P23443 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RPS6KB1P23443 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPS6KB1P23443 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KB1P23443 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KB1P23443 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KB1P23443 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KB1P23443 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KB1P23443 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPS6KB1P23443 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPS6KB1P23443 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RPS6KB1P23443 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPS6KB1P23443 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPS6KB1P23443 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPS6KB1P23443 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RPS6KB1P23443 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RPS6KB1P23443 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RPS6KB1P23443 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RPS6KB1P23443 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RPS6KB1P23443 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RPS6KB1P23443 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RPS6KB1P23443 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
RPS6KB1P23443 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
RPS6KB1P23443 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RPS6KB1P23443 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RPS6KB1P23443 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RPS6KB1P23443 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RPS6KB1P23443 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPS6KB1P23443 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPS6KB1P23443 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPS6KB1P23443 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RPS6KB1P23443 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RPS6KB1P23443 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPS6KB1P23443 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
RPS6KB1P23443 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RPS6KB1P23443 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
RPS6KB1P23443 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
RPS6KB1P23443 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
RPS6KB1P23443 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
RPS6KB1P23443 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RPS6KB1P23443 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
RPS6KB1P23443 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RPS6KB1P23443 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPS6KB1P23443 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPS6KB1P23443 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RPS6KB1P23443 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RPS6KB1P23443 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms