Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH3P22223 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH3P22223 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDH3P22223 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH3P22223 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH3P22223 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH3P22223 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH3P22223 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDH3P22223 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH3P22223 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH3P22223 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH3P22223 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH3P22223 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH3P22223 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH3P22223 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDH3P22223 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDH3P22223 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDH3P22223 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH3P22223 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDH3P22223 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDH3P22223 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDH3P22223 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDH3P22223 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CDH3P22223 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH3P22223 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDH3P22223 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDH3P22223 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDH3P22223 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDH3P22223 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH3P22223 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDH3P22223 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDH3P22223 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH3P22223 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH3P22223 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH3P22223 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH3P22223 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH3P22223 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH3P22223 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH3P22223 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH3P22223 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH3P22223 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CDH3P22223 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDH3P22223 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH3P22223 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH3P22223 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH3P22223 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH3P22223 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH3P22223 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH3P22223 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH3P22223 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH3P22223 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH3P22223 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH3P22223 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH3P22223 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH3P22223 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDH3P22223 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH3P22223 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH3P22223 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH3P22223 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH3P22223 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH3P22223 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH3P22223 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH3P22223 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH3P22223 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH3P22223 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CDH3P22223 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH3P22223 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH3P22223 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH3P22223 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH3P22223 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH3P22223 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH3P22223 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH3P22223 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDH3P22223 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDH3P22223 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDH3P22223 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH3P22223 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH3P22223 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH3P22223 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH3P22223 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH3P22223 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH3P22223 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH3P22223 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH3P22223 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH3P22223 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH3P22223 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH3P22223 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH3P22223 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH3P22223 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH3P22223 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH3P22223 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH3P22223 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH3P22223 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH3P22223 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH3P22223 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDH3P22223 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH3P22223 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH3P22223 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH3P22223 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH3P22223 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms