Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MATN1P21941 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MATN1P21941 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MATN1P21941 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MATN1P21941 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MATN1P21941 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MATN1P21941 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MATN1P21941 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MATN1P21941 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MATN1P21941 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MATN1P21941 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MATN1P21941 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MATN1P21941 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MATN1P21941 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MATN1P21941 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MATN1P21941 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MATN1P21941 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MATN1P21941 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MATN1P21941 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MATN1P21941 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MATN1P21941 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MATN1P21941 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MATN1P21941 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MATN1P21941 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MATN1P21941 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MATN1P21941 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MATN1P21941 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MATN1P21941 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MATN1P21941 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MATN1P21941 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MATN1P21941 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MATN1P21941 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MATN1P21941 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MATN1P21941 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MATN1P21941 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MATN1P21941 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MATN1P21941 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MATN1P21941 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MATN1P21941 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MATN1P21941 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MATN1P21941 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MATN1P21941 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MATN1P21941 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MATN1P21941 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MATN1P21941 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MATN1P21941 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MATN1P21941 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MATN1P21941 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
MATN1P21941 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MATN1P21941 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MATN1P21941 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MATN1P21941 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MATN1P21941 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MATN1P21941 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MATN1P21941 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MATN1P21941 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MATN1P21941 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MATN1P21941 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MATN1P21941 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MATN1P21941 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MATN1P21941 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MATN1P21941 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MATN1P21941 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MATN1P21941 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MATN1P21941 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MATN1P21941 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MATN1P21941 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MATN1P21941 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MATN1P21941 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MATN1P21941 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MATN1P21941 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MATN1P21941 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MATN1P21941 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MATN1P21941 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MATN1P21941 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MATN1P21941 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MATN1P21941 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MATN1P21941 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MATN1P21941 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
MATN1P21941 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MATN1P21941 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MATN1P21941 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
MATN1P21941 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MATN1P21941 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MATN1P21941 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MATN1P21941 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MATN1P21941 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MATN1P21941 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MATN1P21941 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MATN1P21941 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MATN1P21941 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MATN1P21941 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MATN1P21941 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MATN1P21941 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MATN1P21941 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MATN1P21941 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MATN1P21941 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MATN1P21941 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MATN1P21941 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MATN1P21941 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms