Protein–RNA interactions for Protein: P21439

ABCB4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB4P21439 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCB4P21439 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ABCB4P21439 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ABCB4P21439 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ABCB4P21439 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ABCB4P21439 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCB4P21439 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCB4P21439 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ABCB4P21439 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ABCB4P21439 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ABCB4P21439 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ABCB4P21439 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ABCB4P21439 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCB4P21439 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCB4P21439 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ABCB4P21439 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ABCB4P21439 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ABCB4P21439 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ABCB4P21439 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCB4P21439 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCB4P21439 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ABCB4P21439 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ABCB4P21439 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCB4P21439 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ABCB4P21439 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ABCB4P21439 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ABCB4P21439 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ABCB4P21439 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ABCB4P21439 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ABCB4P21439 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ABCB4P21439 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ABCB4P21439 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ABCB4P21439 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCB4P21439 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCB4P21439 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ABCB4P21439 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ABCB4P21439 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ABCB4P21439 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ABCB4P21439 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ABCB4P21439 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCB4P21439 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ABCB4P21439 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCB4P21439 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCB4P21439 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCB4P21439 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCB4P21439 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCB4P21439 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCB4P21439 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ABCB4P21439 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ABCB4P21439 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ABCB4P21439 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms