Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN3P20807 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN3P20807 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN3P20807 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN3P20807 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN3P20807 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN3P20807 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN3P20807 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN3P20807 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN3P20807 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN3P20807 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN3P20807 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN3P20807 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN3P20807 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN3P20807 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN3P20807 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN3P20807 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CAPN3P20807 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CAPN3P20807 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CAPN3P20807 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CAPN3P20807 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN3P20807 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN3P20807 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN3P20807 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN3P20807 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN3P20807 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN3P20807 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN3P20807 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN3P20807 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN3P20807 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CAPN3P20807 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN3P20807 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN3P20807 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN3P20807 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN3P20807 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CAPN3P20807 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CAPN3P20807 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CAPN3P20807 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CAPN3P20807 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CAPN3P20807 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN3P20807 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CAPN3P20807 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN3P20807 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CAPN3P20807 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CAPN3P20807 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CAPN3P20807 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CAPN3P20807 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN3P20807 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN3P20807 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CAPN3P20807 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CAPN3P20807 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN3P20807 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CAPN3P20807 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CAPN3P20807 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN3P20807 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CAPN3P20807 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms