Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB5AP20339 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB5AP20339 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB5AP20339 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB5AP20339 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB5AP20339 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB5AP20339 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB5AP20339 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB5AP20339 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB5AP20339 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB5AP20339 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB5AP20339 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB5AP20339 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RAB5AP20339 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB5AP20339 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB5AP20339 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB5AP20339 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB5AP20339 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB5AP20339 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB5AP20339 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB5AP20339 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB5AP20339 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB5AP20339 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB5AP20339 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB5AP20339 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB5AP20339 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB5AP20339 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB5AP20339 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB5AP20339 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB5AP20339 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB5AP20339 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB5AP20339 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB5AP20339 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB5AP20339 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB5AP20339 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB5AP20339 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB5AP20339 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB5AP20339 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB5AP20339 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB5AP20339 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB5AP20339 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB5AP20339 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB5AP20339 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5AP20339 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5AP20339 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB5AP20339 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB5AP20339 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB5AP20339 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms