Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCLP19338 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCLP19338 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCLP19338 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCLP19338 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NCLP19338 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NCLP19338 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NCLP19338 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCLP19338 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
NCLP19338 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NCLP19338 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCLP19338 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCLP19338 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCLP19338 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NCLP19338 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NCLP19338 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NCLP19338 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
NCLP19338 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NCLP19338 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCLP19338 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NCLP19338 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
NCLP19338 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NCLP19338 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NCLP19338 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NCLP19338 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NCLP19338 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NCLP19338 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NCLP19338 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NCLP19338 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NCLP19338 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
NCLP19338 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCLP19338 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCLP19338 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
NCLP19338 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NCLP19338 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NCLP19338 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NCLP19338 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NCLP19338 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NCLP19338 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCLP19338 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCLP19338 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCLP19338 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NCLP19338 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCLP19338 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NCLP19338 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NCLP19338 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NCLP19338 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NCLP19338 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCLP19338 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCLP19338 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NCLP19338 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NCLP19338 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NCLP19338 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NCLP19338 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
NCLP19338 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NCLP19338 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NCLP19338 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NCLP19338 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NCLP19338 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NCLP19338 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NCLP19338 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCLP19338 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NCLP19338 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCLP19338 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCLP19338 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCLP19338 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NCLP19338 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCLP19338 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCLP19338 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NCLP19338 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCLP19338 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCLP19338 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NCLP19338 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NCLP19338 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NCLP19338 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NCLP19338 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NCLP19338 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NCLP19338 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NCLP19338 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NCLP19338 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCLP19338 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NCLP19338 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCLP19338 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NCLP19338 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NCLP19338 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NCLP19338 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NCLP19338 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NCLP19338 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NCLP19338 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCLP19338 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NCLP19338 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NCLP19338 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCLP19338 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NCLP19338 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
NCLP19338 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NCLP19338 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NCLP19338 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCLP19338 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCLP19338 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NCLP19338 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms