Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
ATF3P18847 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
ATF3P18847 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
ATF3P18847 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ATF3P18847 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ATF3P18847 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
ATF3P18847 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
ATF3P18847 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
ATF3P18847 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
ATF3P18847 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
ATF3P18847 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
ATF3P18847 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
ATF3P18847 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
ATF3P18847 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
ATF3P18847 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
ATF3P18847 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ATF3P18847 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
ATF3P18847 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.17■■■■■ 4.18
ATF3P18847 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.16■■■■■ 4.18
ATF3P18847 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
ATF3P18847 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.14■■■■■ 4.18
ATF3P18847 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
ATF3P18847 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
ATF3P18847 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
ATF3P18847 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.07■■■■■ 4.17
ATF3P18847 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
ATF3P18847 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ATF3P18847 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
ATF3P18847 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
ATF3P18847 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
ATF3P18847 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
ATF3P18847 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
ATF3P18847 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ATF3P18847 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
ATF3P18847 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
ATF3P18847 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
ATF3P18847 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ATF3P18847 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
ATF3P18847 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ATF3P18847 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
ATF3P18847 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC40.8■■■■■ 4.12
ATF3P18847 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
ATF3P18847 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
ATF3P18847 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ATF3P18847 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
ATF3P18847 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
ATF3P18847 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
ATF3P18847 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ATF3P18847 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC40.7■■■■■ 4.11
ATF3P18847 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ATF3P18847 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ATF3P18847 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ATF3P18847 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ATF3P18847 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ATF3P18847 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ATF3P18847 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ATF3P18847 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ATF3P18847 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ATF3P18847 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
ATF3P18847 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
ATF3P18847 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ATF3P18847 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ATF3P18847 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
ATF3P18847 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
ATF3P18847 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
ATF3P18847 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ATF3P18847 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
ATF3P18847 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
ATF3P18847 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ATF3P18847 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ATF3P18847 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ATF3P18847 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
ATF3P18847 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ATF3P18847 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ATF3P18847 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ATF3P18847 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
ATF3P18847 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ATF3P18847 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
ATF3P18847 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ATF3P18847 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ATF3P18847 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ATF3P18847 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.05■■■■■ 4
ATF3P18847 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ATF3P18847 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ATF3P18847 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ATF3P18847 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.04■■■■■ 4
ATF3P18847 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ATF3P18847 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
ATF3P18847 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ATF3P18847 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC40■■■■□ 3.99
ATF3P18847 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
ATF3P18847 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ATF3P18847 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
ATF3P18847 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
ATF3P18847 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ATF3P18847 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
ATF3P18847 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
ATF3P18847 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ATF3P18847 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ATF3P18847 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 214.5 ms