Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRAFP15056 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRAFP15056 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRAFP15056 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRAFP15056 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRAFP15056 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
BRAFP15056 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRAFP15056 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRAFP15056 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRAFP15056 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRAFP15056 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRAFP15056 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRAFP15056 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
BRAFP15056 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRAFP15056 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRAFP15056 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRAFP15056 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRAFP15056 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRAFP15056 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRAFP15056 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRAFP15056 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BRAFP15056 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRAFP15056 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRAFP15056 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRAFP15056 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BRAFP15056 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRAFP15056 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRAFP15056 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRAFP15056 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRAFP15056 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRAFP15056 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRAFP15056 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRAFP15056 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRAFP15056 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRAFP15056 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRAFP15056 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRAFP15056 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRAFP15056 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRAFP15056 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRAFP15056 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRAFP15056 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRAFP15056 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRAFP15056 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRAFP15056 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRAFP15056 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRAFP15056 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRAFP15056 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRAFP15056 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRAFP15056 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRAFP15056 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRAFP15056 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BRAFP15056 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRAFP15056 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BRAFP15056 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRAFP15056 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BRAFP15056 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRAFP15056 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRAFP15056 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BRAFP15056 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRAFP15056 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BRAFP15056 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRAFP15056 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRAFP15056 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRAFP15056 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRAFP15056 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRAFP15056 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRAFP15056 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRAFP15056 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRAFP15056 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRAFP15056 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRAFP15056 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRAFP15056 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRAFP15056 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRAFP15056 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRAFP15056 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRAFP15056 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRAFP15056 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRAFP15056 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRAFP15056 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRAFP15056 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRAFP15056 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRAFP15056 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRAFP15056 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRAFP15056 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRAFP15056 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRAFP15056 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRAFP15056 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRAFP15056 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRAFP15056 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRAFP15056 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRAFP15056 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
BRAFP15056 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRAFP15056 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRAFP15056 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRAFP15056 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRAFP15056 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRAFP15056 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRAFP15056 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRAFP15056 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRAFP15056 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms