Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PEPDP12955 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PEPDP12955 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PEPDP12955 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEPDP12955 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PEPDP12955 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEPDP12955 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEPDP12955 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEPDP12955 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEPDP12955 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEPDP12955 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEPDP12955 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PEPDP12955 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEPDP12955 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEPDP12955 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEPDP12955 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PEPDP12955 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEPDP12955 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEPDP12955 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEPDP12955 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEPDP12955 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEPDP12955 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEPDP12955 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEPDP12955 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEPDP12955 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEPDP12955 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEPDP12955 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEPDP12955 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEPDP12955 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEPDP12955 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEPDP12955 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEPDP12955 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEPDP12955 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEPDP12955 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEPDP12955 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEPDP12955 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEPDP12955 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEPDP12955 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PEPDP12955 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEPDP12955 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEPDP12955 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEPDP12955 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEPDP12955 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEPDP12955 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEPDP12955 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEPDP12955 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEPDP12955 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEPDP12955 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PEPDP12955 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEPDP12955 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PEPDP12955 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PEPDP12955 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PEPDP12955 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PEPDP12955 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEPDP12955 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PEPDP12955 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEPDP12955 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PEPDP12955 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PEPDP12955 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEPDP12955 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEPDP12955 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PEPDP12955 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEPDP12955 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PEPDP12955 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PEPDP12955 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PEPDP12955 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PEPDP12955 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PEPDP12955 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PEPDP12955 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEPDP12955 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PEPDP12955 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEPDP12955 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEPDP12955 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEPDP12955 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEPDP12955 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEPDP12955 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEPDP12955 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEPDP12955 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEPDP12955 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEPDP12955 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEPDP12955 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEPDP12955 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEPDP12955 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEPDP12955 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEPDP12955 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEPDP12955 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEPDP12955 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEPDP12955 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEPDP12955 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEPDP12955 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEPDP12955 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEPDP12955 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEPDP12955 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEPDP12955 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEPDP12955 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEPDP12955 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEPDP12955 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEPDP12955 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEPDP12955 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEPDP12955 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms