Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMIGD3P0DMS9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMIGD3P0DMS9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMIGD3P0DMS9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMIGD3P0DMS9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMIGD3P0DMS9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMIGD3P0DMS9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMIGD3P0DMS9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMIGD3P0DMS9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMIGD3P0DMS9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMIGD3P0DMS9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMIGD3P0DMS9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TMIGD3P0DMS9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMIGD3P0DMS9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMIGD3P0DMS9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMIGD3P0DMS9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMIGD3P0DMS9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMIGD3P0DMS9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMIGD3P0DMS9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMIGD3P0DMS9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMIGD3P0DMS9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMIGD3P0DMS9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMIGD3P0DMS9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMIGD3P0DMS9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMIGD3P0DMS9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMIGD3P0DMS9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMIGD3P0DMS9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMIGD3P0DMS9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMIGD3P0DMS9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMIGD3P0DMS9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMIGD3P0DMS9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMIGD3P0DMS9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMIGD3P0DMS9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMIGD3P0DMS9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TMIGD3P0DMS9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMIGD3P0DMS9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMIGD3P0DMS9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMIGD3P0DMS9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMIGD3P0DMS9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMIGD3P0DMS9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMIGD3P0DMS9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMIGD3P0DMS9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMIGD3P0DMS9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMIGD3P0DMS9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMIGD3P0DMS9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMIGD3P0DMS9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMIGD3P0DMS9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMIGD3P0DMS9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMIGD3P0DMS9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMIGD3P0DMS9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMIGD3P0DMS9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMIGD3P0DMS9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMIGD3P0DMS9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMIGD3P0DMS9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMIGD3P0DMS9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMIGD3P0DMS9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMIGD3P0DMS9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMIGD3P0DMS9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMIGD3P0DMS9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMIGD3P0DMS9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms