Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PNMA6AP0CW24 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PNMA6AP0CW24 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PNMA6AP0CW24 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PNMA6AP0CW24 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PNMA6AP0CW24 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PNMA6AP0CW24 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PNMA6AP0CW24 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PNMA6AP0CW24 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PNMA6AP0CW24 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
PNMA6AP0CW24 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PNMA6AP0CW24 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PNMA6AP0CW24 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PNMA6AP0CW24 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PNMA6AP0CW24 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PNMA6AP0CW24 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PNMA6AP0CW24 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PNMA6AP0CW24 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PNMA6AP0CW24 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PNMA6AP0CW24 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PNMA6AP0CW24 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PNMA6AP0CW24 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNMA6AP0CW24 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNMA6AP0CW24 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PNMA6AP0CW24 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PNMA6AP0CW24 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PNMA6AP0CW24 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PNMA6AP0CW24 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PNMA6AP0CW24 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PNMA6AP0CW24 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNMA6AP0CW24 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PNMA6AP0CW24 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PNMA6AP0CW24 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PNMA6AP0CW24 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PNMA6AP0CW24 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PNMA6AP0CW24 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PNMA6AP0CW24 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PNMA6AP0CW24 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PNMA6AP0CW24 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PNMA6AP0CW24 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA6AP0CW24 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
PNMA6AP0CW24 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PNMA6AP0CW24 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PNMA6AP0CW24 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PNMA6AP0CW24 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PNMA6AP0CW24 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PNMA6AP0CW24 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNMA6AP0CW24 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNMA6AP0CW24 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PNMA6AP0CW24 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PNMA6AP0CW24 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PNMA6AP0CW24 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PNMA6AP0CW24 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PNMA6AP0CW24 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PNMA6AP0CW24 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNMA6AP0CW24 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PNMA6AP0CW24 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNMA6AP0CW24 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
PNMA6AP0CW24 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA6AP0CW24 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA6AP0CW24 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PNMA6AP0CW24 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PNMA6AP0CW24 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PNMA6AP0CW24 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PNMA6AP0CW24 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PNMA6AP0CW24 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA6AP0CW24 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA6AP0CW24 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PNMA6AP0CW24 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PNMA6AP0CW24 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PNMA6AP0CW24 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PNMA6AP0CW24 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms