Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M7

ACSM4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM4P0C7M7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACSM4P0C7M7 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACSM4P0C7M7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACSM4P0C7M7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM4P0C7M7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM4P0C7M7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM4P0C7M7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACSM4P0C7M7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSM4P0C7M7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACSM4P0C7M7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACSM4P0C7M7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACSM4P0C7M7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ACSM4P0C7M7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSM4P0C7M7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSM4P0C7M7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACSM4P0C7M7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACSM4P0C7M7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACSM4P0C7M7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACSM4P0C7M7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACSM4P0C7M7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACSM4P0C7M7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSM4P0C7M7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSM4P0C7M7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACSM4P0C7M7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACSM4P0C7M7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSM4P0C7M7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACSM4P0C7M7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSM4P0C7M7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACSM4P0C7M7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSM4P0C7M7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACSM4P0C7M7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACSM4P0C7M7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSM4P0C7M7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACSM4P0C7M7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ACSM4P0C7M7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ACSM4P0C7M7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSM4P0C7M7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSM4P0C7M7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSM4P0C7M7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSM4P0C7M7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSM4P0C7M7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSM4P0C7M7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSM4P0C7M7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSM4P0C7M7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSM4P0C7M7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSM4P0C7M7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSM4P0C7M7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSM4P0C7M7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms