Protein–RNA interactions for Protein: P0C091

FREM3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM3P0C091 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FREM3P0C091 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FREM3P0C091 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FREM3P0C091 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FREM3P0C091 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FREM3P0C091 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FREM3P0C091 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FREM3P0C091 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FREM3P0C091 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FREM3P0C091 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FREM3P0C091 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FREM3P0C091 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FREM3P0C091 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FREM3P0C091 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FREM3P0C091 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FREM3P0C091 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FREM3P0C091 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FREM3P0C091 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FREM3P0C091 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FREM3P0C091 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FREM3P0C091 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FREM3P0C091 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FREM3P0C091 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FREM3P0C091 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FREM3P0C091 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FREM3P0C091 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FREM3P0C091 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FREM3P0C091 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FREM3P0C091 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FREM3P0C091 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FREM3P0C091 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FREM3P0C091 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FREM3P0C091 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FREM3P0C091 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FREM3P0C091 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FREM3P0C091 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FREM3P0C091 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FREM3P0C091 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FREM3P0C091 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FREM3P0C091 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FREM3P0C091 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FREM3P0C091 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FREM3P0C091 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FREM3P0C091 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FREM3P0C091 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FREM3P0C091 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FREM3P0C091 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FREM3P0C091 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FREM3P0C091 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FREM3P0C091 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FREM3P0C091 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FREM3P0C091 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FREM3P0C091 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FREM3P0C091 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FREM3P0C091 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FREM3P0C091 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FREM3P0C091 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FREM3P0C091 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FREM3P0C091 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FREM3P0C091 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FREM3P0C091 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FREM3P0C091 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FREM3P0C091 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FREM3P0C091 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FREM3P0C091 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FREM3P0C091 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.2 ms