Protein–RNA interactions for Protein: P08514

ITGA2B, Integrin alpha-IIb, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2BP08514 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA2BP08514 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ITGA2BP08514 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ITGA2BP08514 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA2BP08514 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ITGA2BP08514 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ITGA2BP08514 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA2BP08514 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA2BP08514 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ITGA2BP08514 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ITGA2BP08514 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA2BP08514 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGA2BP08514 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA2BP08514 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA2BP08514 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA2BP08514 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGA2BP08514 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA2BP08514 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA2BP08514 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGA2BP08514 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ITGA2BP08514 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ITGA2BP08514 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA2BP08514 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA2BP08514 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGA2BP08514 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA2BP08514 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
ITGA2BP08514 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGA2BP08514 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA2BP08514 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA2BP08514 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGA2BP08514 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA2BP08514 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGA2BP08514 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA2BP08514 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGA2BP08514 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ITGA2BP08514 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGA2BP08514 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA2BP08514 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA2BP08514 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGA2BP08514 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA2BP08514 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGA2BP08514 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA2BP08514 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA2BP08514 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGA2BP08514 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGA2BP08514 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA2BP08514 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGA2BP08514 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITGA2BP08514 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGA2BP08514 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA2BP08514 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA2BP08514 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA2BP08514 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGA2BP08514 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ITGA2BP08514 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGA2BP08514 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA2BP08514 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ITGA2BP08514 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms