Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOD3P08294 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOD3P08294 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SOD3P08294 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SOD3P08294 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SOD3P08294 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SOD3P08294 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SOD3P08294 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SOD3P08294 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SOD3P08294 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SOD3P08294 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD3P08294 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD3P08294 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SOD3P08294 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOD3P08294 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOD3P08294 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOD3P08294 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOD3P08294 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOD3P08294 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOD3P08294 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOD3P08294 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOD3P08294 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOD3P08294 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOD3P08294 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOD3P08294 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOD3P08294 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD3P08294 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD3P08294 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOD3P08294 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOD3P08294 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOD3P08294 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOD3P08294 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD3P08294 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD3P08294 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOD3P08294 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOD3P08294 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOD3P08294 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOD3P08294 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOD3P08294 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD3P08294 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOD3P08294 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOD3P08294 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOD3P08294 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOD3P08294 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD3P08294 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOD3P08294 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD3P08294 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOD3P08294 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOD3P08294 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOD3P08294 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOD3P08294 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOD3P08294 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SOD3P08294 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOD3P08294 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SOD3P08294 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SOD3P08294 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOD3P08294 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SOD3P08294 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SOD3P08294 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOD3P08294 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SOD3P08294 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SOD3P08294 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SOD3P08294 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SOD3P08294 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOD3P08294 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOD3P08294 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SOD3P08294 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOD3P08294 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SOD3P08294 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SOD3P08294 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SOD3P08294 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SOD3P08294 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SOD3P08294 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOD3P08294 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOD3P08294 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SOD3P08294 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOD3P08294 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOD3P08294 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SOD3P08294 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD3P08294 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOD3P08294 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOD3P08294 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SOD3P08294 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD3P08294 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOD3P08294 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOD3P08294 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOD3P08294 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOD3P08294 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD3P08294 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD3P08294 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SOD3P08294 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOD3P08294 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD3P08294 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD3P08294 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOD3P08294 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOD3P08294 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOD3P08294 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOD3P08294 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOD3P08294 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOD3P08294 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms