Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAPN1P07384 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN1P07384 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAPN1P07384 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAPN1P07384 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN1P07384 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN1P07384 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAPN1P07384 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CAPN1P07384 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CAPN1P07384 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CAPN1P07384 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAPN1P07384 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAPN1P07384 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAPN1P07384 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAPN1P07384 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAPN1P07384 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN1P07384 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAPN1P07384 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN1P07384 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAPN1P07384 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN1P07384 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CAPN1P07384 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN1P07384 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAPN1P07384 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN1P07384 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAPN1P07384 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CAPN1P07384 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CAPN1P07384 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CAPN1P07384 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CAPN1P07384 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN1P07384 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CAPN1P07384 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN1P07384 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CAPN1P07384 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CAPN1P07384 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CAPN1P07384 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CAPN1P07384 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CAPN1P07384 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CAPN1P07384 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CAPN1P07384 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CAPN1P07384 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAPN1P07384 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CAPN1P07384 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CAPN1P07384 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CAPN1P07384 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN1P07384 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CAPN1P07384 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CAPN1P07384 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CAPN1P07384 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN1P07384 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CAPN1P07384 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CAPN1P07384 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CAPN1P07384 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms