Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEFLP07196 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NEFLP07196 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NEFLP07196 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NEFLP07196 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEFLP07196 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEFLP07196 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NEFLP07196 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NEFLP07196 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEFLP07196 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NEFLP07196 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NEFLP07196 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NEFLP07196 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NEFLP07196 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NEFLP07196 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NEFLP07196 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
NEFLP07196 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NEFLP07196 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NEFLP07196 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NEFLP07196 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
NEFLP07196 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEFLP07196 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NEFLP07196 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NEFLP07196 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NEFLP07196 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NEFLP07196 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEFLP07196 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NEFLP07196 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NEFLP07196 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NEFLP07196 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NEFLP07196 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NEFLP07196 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEFLP07196 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NEFLP07196 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NEFLP07196 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NEFLP07196 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NEFLP07196 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NEFLP07196 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NEFLP07196 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NEFLP07196 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NEFLP07196 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NEFLP07196 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NEFLP07196 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NEFLP07196 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NEFLP07196 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NEFLP07196 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NEFLP07196 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NEFLP07196 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NEFLP07196 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NEFLP07196 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NEFLP07196 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NEFLP07196 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NEFLP07196 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NEFLP07196 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NEFLP07196 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NEFLP07196 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
NEFLP07196 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NEFLP07196 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NEFLP07196 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NEFLP07196 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
NEFLP07196 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NEFLP07196 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
NEFLP07196 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NEFLP07196 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NEFLP07196 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NEFLP07196 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NEFLP07196 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NEFLP07196 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
NEFLP07196 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
NEFLP07196 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NEFLP07196 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NEFLP07196 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NEFLP07196 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEFLP07196 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEFLP07196 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NEFLP07196 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NEFLP07196 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NEFLP07196 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NEFLP07196 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NEFLP07196 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NEFLP07196 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NEFLP07196 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NEFLP07196 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NEFLP07196 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NEFLP07196 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NEFLP07196 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEFLP07196 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NEFLP07196 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NEFLP07196 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NEFLP07196 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NEFLP07196 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NEFLP07196 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NEFLP07196 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEFLP07196 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NEFLP07196 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NEFLP07196 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEFLP07196 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NEFLP07196 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEFLP07196 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NEFLP07196 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.5 ms