Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
APOA4P06727 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOA4P06727 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
APOA4P06727 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOA4P06727 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
APOA4P06727 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
APOA4P06727 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOA4P06727 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
APOA4P06727 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOA4P06727 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
APOA4P06727 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
APOA4P06727 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
APOA4P06727 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
APOA4P06727 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
APOA4P06727 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOA4P06727 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
APOA4P06727 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA4P06727 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
APOA4P06727 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOA4P06727 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
APOA4P06727 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
APOA4P06727 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOA4P06727 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
APOA4P06727 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
APOA4P06727 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
APOA4P06727 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
APOA4P06727 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOA4P06727 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOA4P06727 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
APOA4P06727 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APOA4P06727 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APOA4P06727 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APOA4P06727 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APOA4P06727 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOA4P06727 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOA4P06727 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOA4P06727 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APOA4P06727 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APOA4P06727 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
APOA4P06727 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
APOA4P06727 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
APOA4P06727 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
APOA4P06727 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
APOA4P06727 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOA4P06727 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
APOA4P06727 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOA4P06727 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOA4P06727 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
APOA4P06727 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA4P06727 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
APOA4P06727 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOA4P06727 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
APOA4P06727 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
APOA4P06727 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
APOA4P06727 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
APOA4P06727 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
APOA4P06727 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
APOA4P06727 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
APOA4P06727 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA4P06727 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA4P06727 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA4P06727 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA4P06727 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
APOA4P06727 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA4P06727 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA4P06727 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
APOA4P06727 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
APOA4P06727 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
APOA4P06727 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA4P06727 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA4P06727 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA4P06727 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
APOA4P06727 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOA4P06727 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
APOA4P06727 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
APOA4P06727 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
APOA4P06727 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA4P06727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
APOA4P06727 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
APOA4P06727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
APOA4P06727 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
APOA4P06727 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA4P06727 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
APOA4P06727 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA4P06727 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA4P06727 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA4P06727 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
APOA4P06727 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA4P06727 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA4P06727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA4P06727 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
APOA4P06727 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
APOA4P06727 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
APOA4P06727 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
APOA4P06727 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA4P06727 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA4P06727 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
APOA4P06727 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
APOA4P06727 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
APOA4P06727 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms