Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYL1P05976 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYL1P05976 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYL1P05976 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MYL1P05976 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYL1P05976 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYL1P05976 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
MYL1P05976 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MYL1P05976 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYL1P05976 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYL1P05976 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
MYL1P05976 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MYL1P05976 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MYL1P05976 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MYL1P05976 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MYL1P05976 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MYL1P05976 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
MYL1P05976 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
MYL1P05976 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MYL1P05976 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MYL1P05976 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
MYL1P05976 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
MYL1P05976 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MYL1P05976 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYL1P05976 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
MYL1P05976 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
MYL1P05976 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MYL1P05976 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MYL1P05976 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
MYL1P05976 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
MYL1P05976 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
MYL1P05976 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYL1P05976 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
MYL1P05976 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
MYL1P05976 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
MYL1P05976 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
MYL1P05976 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYL1P05976 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
MYL1P05976 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYL1P05976 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
MYL1P05976 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
MYL1P05976 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYL1P05976 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
MYL1P05976 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYL1P05976 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
MYL1P05976 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
MYL1P05976 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
MYL1P05976 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
MYL1P05976 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
MYL1P05976 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
MYL1P05976 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYL1P05976 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
MYL1P05976 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
MYL1P05976 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
MYL1P05976 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
MYL1P05976 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
MYL1P05976 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
MYL1P05976 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
MYL1P05976 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
MYL1P05976 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MYL1P05976 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
MYL1P05976 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
MYL1P05976 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MYL1P05976 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MYL1P05976 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
MYL1P05976 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MYL1P05976 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MYL1P05976 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
MYL1P05976 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MYL1P05976 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MYL1P05976 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
MYL1P05976 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
MYL1P05976 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYL1P05976 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
MYL1P05976 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
MYL1P05976 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYL1P05976 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
MYL1P05976 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYL1P05976 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
MYL1P05976 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
MYL1P05976 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MYL1P05976 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MYL1P05976 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
MYL1P05976 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
MYL1P05976 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
MYL1P05976 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYL1P05976 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
MYL1P05976 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
MYL1P05976 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYL1P05976 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYL1P05976 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
MYL1P05976 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYL1P05976 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
MYL1P05976 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
MYL1P05976 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYL1P05976 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYL1P05976 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
MYL1P05976 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MYL1P05976 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
MYL1P05976 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms