Protein–RNA interactions for Protein: P05231

IL6, Interleukin-6, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL6P05231 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IL6P05231 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IL6P05231 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
IL6P05231 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
IL6P05231 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IL6P05231 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IL6P05231 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
IL6P05231 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IL6P05231 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IL6P05231 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IL6P05231 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IL6P05231 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IL6P05231 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IL6P05231 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IL6P05231 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IL6P05231 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IL6P05231 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IL6P05231 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL6P05231 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IL6P05231 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IL6P05231 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IL6P05231 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
IL6P05231 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL6P05231 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL6P05231 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL6P05231 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IL6P05231 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
IL6P05231 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IL6P05231 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IL6P05231 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IL6P05231 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IL6P05231 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IL6P05231 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IL6P05231 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IL6P05231 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IL6P05231 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IL6P05231 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL6P05231 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL6P05231 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IL6P05231 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IL6P05231 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IL6P05231 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IL6P05231 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IL6P05231 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IL6P05231 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IL6P05231 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IL6P05231 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IL6P05231 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IL6P05231 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IL6P05231 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IL6P05231 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IL6P05231 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IL6P05231 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IL6P05231 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IL6P05231 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IL6P05231 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IL6P05231 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IL6P05231 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IL6P05231 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IL6P05231 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IL6P05231 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IL6P05231 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IL6P05231 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IL6P05231 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IL6P05231 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IL6P05231 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IL6P05231 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IL6P05231 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IL6P05231 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IL6P05231 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IL6P05231 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IL6P05231 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IL6P05231 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IL6P05231 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IL6P05231 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IL6P05231 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IL6P05231 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IL6P05231 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IL6P05231 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IL6P05231 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IL6P05231 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IL6P05231 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IL6P05231 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IL6P05231 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IL6P05231 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IL6P05231 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IL6P05231 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
IL6P05231 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IL6P05231 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
IL6P05231 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IL6P05231 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IL6P05231 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IL6P05231 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IL6P05231 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IL6P05231 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IL6P05231 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IL6P05231 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IL6P05231 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IL6P05231 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IL6P05231 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms