Protein–RNA interactions for Protein: P01764

IGHV3-23, Immunoglobulin heavy variable 3-23, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-23P01764 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV3-23P01764 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV3-23P01764 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV3-23P01764 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV3-23P01764 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-23P01764 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-23P01764 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-23P01764 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV3-23P01764 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-23P01764 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGHV3-23P01764 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-23P01764 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-23P01764 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-23P01764 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-23P01764 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-23P01764 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGHV3-23P01764 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-23P01764 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-23P01764 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-23P01764 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHV3-23P01764 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-23P01764 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-23P01764 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-23P01764 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-23P01764 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-23P01764 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-23P01764 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
IGHV3-23P01764 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-23P01764 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGHV3-23P01764 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-23P01764 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGHV3-23P01764 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-23P01764 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGHV3-23P01764 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGHV3-23P01764 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGHV3-23P01764 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
IGHV3-23P01764 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGHV3-23P01764 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV3-23P01764 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
IGHV3-23P01764 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
IGHV3-23P01764 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
IGHV3-23P01764 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms