Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TOMM40O96008 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TOMM40O96008 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TOMM40O96008 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TOMM40O96008 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TOMM40O96008 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TOMM40O96008 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TOMM40O96008 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TOMM40O96008 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TOMM40O96008 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TOMM40O96008 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TOMM40O96008 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOMM40O96008 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TOMM40O96008 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TOMM40O96008 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms