Protein–RNA interactions for Protein: O95164

UBL3, Ubiquitin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL3O95164 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBL3O95164 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBL3O95164 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBL3O95164 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBL3O95164 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBL3O95164 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBL3O95164 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBL3O95164 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBL3O95164 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBL3O95164 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBL3O95164 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBL3O95164 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBL3O95164 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBL3O95164 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBL3O95164 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBL3O95164 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBL3O95164 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBL3O95164 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBL3O95164 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBL3O95164 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBL3O95164 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBL3O95164 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBL3O95164 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBL3O95164 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL3O95164 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL3O95164 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL3O95164 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL3O95164 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL3O95164 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL3O95164 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL3O95164 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL3O95164 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL3O95164 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL3O95164 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL3O95164 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL3O95164 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL3O95164 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL3O95164 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL3O95164 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL3O95164 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL3O95164 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL3O95164 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL3O95164 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL3O95164 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL3O95164 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL3O95164 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL3O95164 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBL3O95164 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL3O95164 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL3O95164 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL3O95164 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL3O95164 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL3O95164 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL3O95164 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UBL3O95164 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL3O95164 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL3O95164 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UBL3O95164 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UBL3O95164 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBL3O95164 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL3O95164 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBL3O95164 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBL3O95164 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL3O95164 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL3O95164 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL3O95164 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBL3O95164 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL3O95164 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBL3O95164 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBL3O95164 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBL3O95164 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL3O95164 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBL3O95164 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBL3O95164 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBL3O95164 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBL3O95164 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBL3O95164 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBL3O95164 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBL3O95164 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL3O95164 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL3O95164 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL3O95164 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL3O95164 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL3O95164 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL3O95164 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL3O95164 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL3O95164 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL3O95164 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL3O95164 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL3O95164 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL3O95164 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL3O95164 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL3O95164 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL3O95164 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL3O95164 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL3O95164 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL3O95164 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL3O95164 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBL3O95164 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBL3O95164 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms