Protein–RNA interactions for Protein: O95025

SEMA3D, Semaphorin-3D, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3DO95025 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA3DO95025 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SEMA3DO95025 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SEMA3DO95025 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SEMA3DO95025 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SEMA3DO95025 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SEMA3DO95025 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3DO95025 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SEMA3DO95025 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SEMA3DO95025 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SEMA3DO95025 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3DO95025 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SEMA3DO95025 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3DO95025 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SEMA3DO95025 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SEMA3DO95025 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SEMA3DO95025 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3DO95025 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SEMA3DO95025 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEMA3DO95025 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEMA3DO95025 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEMA3DO95025 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEMA3DO95025 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEMA3DO95025 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEMA3DO95025 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEMA3DO95025 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEMA3DO95025 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEMA3DO95025 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3DO95025 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEMA3DO95025 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3DO95025 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEMA3DO95025 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3DO95025 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEMA3DO95025 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3DO95025 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEMA3DO95025 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEMA3DO95025 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEMA3DO95025 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SEMA3DO95025 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SEMA3DO95025 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3DO95025 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SEMA3DO95025 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEMA3DO95025 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEMA3DO95025 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEMA3DO95025 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEMA3DO95025 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SEMA3DO95025 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEMA3DO95025 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEMA3DO95025 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SEMA3DO95025 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms