Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DKK1O94907 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DKK1O94907 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DKK1O94907 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DKK1O94907 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DKK1O94907 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DKK1O94907 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DKK1O94907 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DKK1O94907 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DKK1O94907 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DKK1O94907 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DKK1O94907 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DKK1O94907 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DKK1O94907 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DKK1O94907 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DKK1O94907 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DKK1O94907 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DKK1O94907 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DKK1O94907 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DKK1O94907 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DKK1O94907 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DKK1O94907 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
DKK1O94907 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DKK1O94907 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DKK1O94907 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DKK1O94907 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DKK1O94907 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DKK1O94907 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DKK1O94907 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DKK1O94907 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DKK1O94907 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DKK1O94907 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DKK1O94907 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DKK1O94907 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DKK1O94907 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DKK1O94907 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DKK1O94907 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DKK1O94907 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DKK1O94907 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DKK1O94907 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DKK1O94907 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DKK1O94907 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DKK1O94907 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DKK1O94907 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DKK1O94907 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DKK1O94907 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DKK1O94907 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DKK1O94907 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DKK1O94907 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DKK1O94907 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DKK1O94907 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DKK1O94907 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DKK1O94907 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DKK1O94907 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DKK1O94907 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DKK1O94907 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DKK1O94907 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
DKK1O94907 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DKK1O94907 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DKK1O94907 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DKK1O94907 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DKK1O94907 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DKK1O94907 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DKK1O94907 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DKK1O94907 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DKK1O94907 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DKK1O94907 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DKK1O94907 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DKK1O94907 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DKK1O94907 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DKK1O94907 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DKK1O94907 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DKK1O94907 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DKK1O94907 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DKK1O94907 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DKK1O94907 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DKK1O94907 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DKK1O94907 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DKK1O94907 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DKK1O94907 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DKK1O94907 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DKK1O94907 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DKK1O94907 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
DKK1O94907 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DKK1O94907 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DKK1O94907 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DKK1O94907 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DKK1O94907 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DKK1O94907 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DKK1O94907 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DKK1O94907 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DKK1O94907 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DKK1O94907 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DKK1O94907 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DKK1O94907 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DKK1O94907 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DKK1O94907 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DKK1O94907 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DKK1O94907 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DKK1O94907 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms