Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ECM2O94769 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ECM2O94769 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ECM2O94769 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ECM2O94769 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ECM2O94769 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ECM2O94769 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ECM2O94769 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ECM2O94769 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
ECM2O94769 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ECM2O94769 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
ECM2O94769 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ECM2O94769 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ECM2O94769 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ECM2O94769 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ECM2O94769 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ECM2O94769 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ECM2O94769 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ECM2O94769 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ECM2O94769 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.77■■■■□ 3
ECM2O94769 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ECM2O94769 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ECM2O94769 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ECM2O94769 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
ECM2O94769 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ECM2O94769 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ECM2O94769 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ECM2O94769 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ECM2O94769 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ECM2O94769 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ECM2O94769 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ECM2O94769 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ECM2O94769 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ECM2O94769 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ECM2O94769 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ECM2O94769 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ECM2O94769 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ECM2O94769 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ECM2O94769 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ECM2O94769 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ECM2O94769 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ECM2O94769 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ECM2O94769 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ECM2O94769 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ECM2O94769 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ECM2O94769 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ECM2O94769 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ECM2O94769 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ECM2O94769 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ECM2O94769 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ECM2O94769 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ECM2O94769 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ECM2O94769 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ECM2O94769 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ECM2O94769 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ECM2O94769 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ECM2O94769 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ECM2O94769 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ECM2O94769 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ECM2O94769 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ECM2O94769 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ECM2O94769 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ECM2O94769 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ECM2O94769 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ECM2O94769 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ECM2O94769 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ECM2O94769 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ECM2O94769 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
ECM2O94769 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ECM2O94769 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM2O94769 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM2O94769 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM2O94769 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM2O94769 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ECM2O94769 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ECM2O94769 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ECM2O94769 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ECM2O94769 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ECM2O94769 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ECM2O94769 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
ECM2O94769 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ECM2O94769 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ECM2O94769 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ECM2O94769 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ECM2O94769 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ECM2O94769 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ECM2O94769 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ECM2O94769 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ECM2O94769 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
ECM2O94769 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ECM2O94769 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ECM2O94769 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ECM2O94769 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
ECM2O94769 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ECM2O94769 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ECM2O94769 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ECM2O94769 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ECM2O94769 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ECM2O94769 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ECM2O94769 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms