Protein–RNA interactions for Protein: O75841

UPK1B, Uroplakin-1b, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1BO75841 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UPK1BO75841 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UPK1BO75841 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UPK1BO75841 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UPK1BO75841 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UPK1BO75841 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UPK1BO75841 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPK1BO75841 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPK1BO75841 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPK1BO75841 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPK1BO75841 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPK1BO75841 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UPK1BO75841 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UPK1BO75841 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK1BO75841 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UPK1BO75841 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UPK1BO75841 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UPK1BO75841 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UPK1BO75841 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UPK1BO75841 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UPK1BO75841 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK1BO75841 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UPK1BO75841 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPK1BO75841 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UPK1BO75841 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK1BO75841 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK1BO75841 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UPK1BO75841 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UPK1BO75841 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UPK1BO75841 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK1BO75841 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK1BO75841 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK1BO75841 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK1BO75841 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPK1BO75841 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPK1BO75841 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK1BO75841 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK1BO75841 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK1BO75841 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK1BO75841 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK1BO75841 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPK1BO75841 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK1BO75841 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK1BO75841 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPK1BO75841 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK1BO75841 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK1BO75841 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK1BO75841 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPK1BO75841 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK1BO75841 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK1BO75841 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK1BO75841 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK1BO75841 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UPK1BO75841 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1BO75841 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK1BO75841 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK1BO75841 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK1BO75841 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UPK1BO75841 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK1BO75841 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK1BO75841 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK1BO75841 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK1BO75841 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK1BO75841 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK1BO75841 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPK1BO75841 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPK1BO75841 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms