Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
EIF3JO75822 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
EIF3JO75822 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
EIF3JO75822 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EIF3JO75822 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
EIF3JO75822 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
EIF3JO75822 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
EIF3JO75822 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
EIF3JO75822 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EIF3JO75822 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
EIF3JO75822 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
EIF3JO75822 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
EIF3JO75822 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
EIF3JO75822 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
EIF3JO75822 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
EIF3JO75822 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
EIF3JO75822 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
EIF3JO75822 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
EIF3JO75822 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
EIF3JO75822 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
EIF3JO75822 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
EIF3JO75822 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
EIF3JO75822 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
EIF3JO75822 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
EIF3JO75822 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
EIF3JO75822 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EIF3JO75822 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EIF3JO75822 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
EIF3JO75822 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
EIF3JO75822 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EIF3JO75822 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
EIF3JO75822 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
EIF3JO75822 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
EIF3JO75822 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
EIF3JO75822 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EIF3JO75822 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
EIF3JO75822 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
EIF3JO75822 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
EIF3JO75822 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
EIF3JO75822 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EIF3JO75822 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EIF3JO75822 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EIF3JO75822 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EIF3JO75822 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EIF3JO75822 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EIF3JO75822 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EIF3JO75822 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EIF3JO75822 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EIF3JO75822 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EIF3JO75822 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
EIF3JO75822 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
EIF3JO75822 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
EIF3JO75822 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
EIF3JO75822 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
EIF3JO75822 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EIF3JO75822 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
EIF3JO75822 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
EIF3JO75822 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
EIF3JO75822 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EIF3JO75822 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
EIF3JO75822 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
EIF3JO75822 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EIF3JO75822 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
EIF3JO75822 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EIF3JO75822 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
EIF3JO75822 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
EIF3JO75822 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
EIF3JO75822 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
EIF3JO75822 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
EIF3JO75822 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
EIF3JO75822 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EIF3JO75822 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EIF3JO75822 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
EIF3JO75822 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
EIF3JO75822 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
EIF3JO75822 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
EIF3JO75822 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
EIF3JO75822 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EIF3JO75822 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms