Protein–RNA interactions for Protein: O60831

PRAF2, PRA1 family protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAF2O60831 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAF2O60831 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAF2O60831 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAF2O60831 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAF2O60831 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAF2O60831 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAF2O60831 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAF2O60831 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAF2O60831 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAF2O60831 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAF2O60831 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAF2O60831 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAF2O60831 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAF2O60831 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAF2O60831 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAF2O60831 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAF2O60831 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAF2O60831 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAF2O60831 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRAF2O60831 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRAF2O60831 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRAF2O60831 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAF2O60831 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRAF2O60831 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAF2O60831 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAF2O60831 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAF2O60831 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAF2O60831 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAF2O60831 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAF2O60831 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAF2O60831 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAF2O60831 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAF2O60831 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAF2O60831 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAF2O60831 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAF2O60831 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRAF2O60831 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAF2O60831 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRAF2O60831 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAF2O60831 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRAF2O60831 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRAF2O60831 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAF2O60831 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAF2O60831 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAF2O60831 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAF2O60831 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAF2O60831 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAF2O60831 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAF2O60831 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms