Protein–RNA interactions for Protein: O43747

AP1G1, AP-1 complex subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1G1O43747 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP1G1O43747 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AP1G1O43747 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AP1G1O43747 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AP1G1O43747 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AP1G1O43747 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
AP1G1O43747 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AP1G1O43747 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AP1G1O43747 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP1G1O43747 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AP1G1O43747 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP1G1O43747 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
AP1G1O43747 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP1G1O43747 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP1G1O43747 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AP1G1O43747 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AP1G1O43747 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AP1G1O43747 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AP1G1O43747 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AP1G1O43747 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AP1G1O43747 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
AP1G1O43747 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP1G1O43747 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AP1G1O43747 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AP1G1O43747 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AP1G1O43747 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AP1G1O43747 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AP1G1O43747 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AP1G1O43747 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
AP1G1O43747 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AP1G1O43747 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP1G1O43747 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AP1G1O43747 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
AP1G1O43747 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP1G1O43747 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AP1G1O43747 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
AP1G1O43747 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP1G1O43747 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP1G1O43747 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP1G1O43747 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
AP1G1O43747 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AP1G1O43747 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AP1G1O43747 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AP1G1O43747 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP1G1O43747 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP1G1O43747 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AP1G1O43747 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AP1G1O43747 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP1G1O43747 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AP1G1O43747 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AP1G1O43747 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AP1G1O43747 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AP1G1O43747 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AP1G1O43747 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP1G1O43747 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AP1G1O43747 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP1G1O43747 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AP1G1O43747 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AP1G1O43747 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AP1G1O43747 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
AP1G1O43747 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AP1G1O43747 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
AP1G1O43747 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
AP1G1O43747 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP1G1O43747 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP1G1O43747 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
AP1G1O43747 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP1G1O43747 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
AP1G1O43747 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
AP1G1O43747 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
AP1G1O43747 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AP1G1O43747 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AP1G1O43747 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
AP1G1O43747 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
AP1G1O43747 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AP1G1O43747 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AP1G1O43747 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP1G1O43747 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AP1G1O43747 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AP1G1O43747 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AP1G1O43747 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AP1G1O43747 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
AP1G1O43747 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms