Protein–RNA interactions for Protein: O43301

HSPA12A, Heat shock 70 kDa protein 12A, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA12AO43301 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HSPA12AO43301 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HSPA12AO43301 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HSPA12AO43301 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA12AO43301 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HSPA12AO43301 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HSPA12AO43301 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HSPA12AO43301 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HSPA12AO43301 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HSPA12AO43301 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HSPA12AO43301 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA12AO43301 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HSPA12AO43301 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HSPA12AO43301 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HSPA12AO43301 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSPA12AO43301 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSPA12AO43301 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPA12AO43301 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSPA12AO43301 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPA12AO43301 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSPA12AO43301 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSPA12AO43301 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPA12AO43301 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSPA12AO43301 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA12AO43301 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSPA12AO43301 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSPA12AO43301 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSPA12AO43301 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA12AO43301 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA12AO43301 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSPA12AO43301 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSPA12AO43301 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA12AO43301 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSPA12AO43301 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSPA12AO43301 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSPA12AO43301 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HSPA12AO43301 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPA12AO43301 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms