Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ABCC4O15439 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ABCC4O15439 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ABCC4O15439 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ABCC4O15439 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
ABCC4O15439 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ABCC4O15439 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC4O15439 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC4O15439 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ABCC4O15439 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ABCC4O15439 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ABCC4O15439 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
ABCC4O15439 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ABCC4O15439 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC4O15439 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ABCC4O15439 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC4O15439 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ABCC4O15439 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ABCC4O15439 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
ABCC4O15439 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC4O15439 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC4O15439 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC4O15439 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC4O15439 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC4O15439 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC4O15439 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC4O15439 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
ABCC4O15439 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
ABCC4O15439 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
ABCC4O15439 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
ABCC4O15439 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
ABCC4O15439 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
ABCC4O15439 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
ABCC4O15439 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
ABCC4O15439 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
ABCC4O15439 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
ABCC4O15439 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
ABCC4O15439 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
ABCC4O15439 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
ABCC4O15439 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
ABCC4O15439 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC4O15439 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
ABCC4O15439 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
ABCC4O15439 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC4O15439 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC4O15439 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC4O15439 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC4O15439 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC4O15439 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC4O15439 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC4O15439 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC4O15439 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC4O15439 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC4O15439 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC4O15439 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC4O15439 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC4O15439 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC4O15439 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC4O15439 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC4O15439 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ABCC4O15439 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ABCC4O15439 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC4O15439 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ABCC4O15439 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
ABCC4O15439 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
ABCC4O15439 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
ABCC4O15439 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ABCC4O15439 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ABCC4O15439 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC4O15439 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ABCC4O15439 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ABCC4O15439 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
ABCC4O15439 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ABCC4O15439 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
ABCC4O15439 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ABCC4O15439 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
ABCC4O15439 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
ABCC4O15439 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ABCC4O15439 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ABCC4O15439 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC4O15439 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ABCC4O15439 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ABCC4O15439 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
ABCC4O15439 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
ABCC4O15439 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms