Protein–RNA interactions for Protein: O15172

PSPHP1, Putative phosphoserine phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP1O15172 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PSPHP1O15172 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PSPHP1O15172 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PSPHP1O15172 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSPHP1O15172 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PSPHP1O15172 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PSPHP1O15172 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PSPHP1O15172 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PSPHP1O15172 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSPHP1O15172 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PSPHP1O15172 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSPHP1O15172 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSPHP1O15172 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232 ms