Protein–RNA interactions for Protein: O15172

PSPHP1, Putative phosphoserine phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPHP1O15172 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSPHP1O15172 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSPHP1O15172 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSPHP1O15172 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PSPHP1O15172 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PSPHP1O15172 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PSPHP1O15172 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PSPHP1O15172 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSPHP1O15172 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSPHP1O15172 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSPHP1O15172 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PSPHP1O15172 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PSPHP1O15172 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSPHP1O15172 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSPHP1O15172 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSPHP1O15172 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSPHP1O15172 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSPHP1O15172 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSPHP1O15172 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSPHP1O15172 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSPHP1O15172 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PSPHP1O15172 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PSPHP1O15172 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PSPHP1O15172 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PSPHP1O15172 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PSPHP1O15172 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PSPHP1O15172 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PSPHP1O15172 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PSPHP1O15172 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSPHP1O15172 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PSPHP1O15172 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PSPHP1O15172 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSPHP1O15172 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSPHP1O15172 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSPHP1O15172 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSPHP1O15172 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSPHP1O15172 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSPHP1O15172 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSPHP1O15172 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PSPHP1O15172 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSPHP1O15172 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PSPHP1O15172 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PSPHP1O15172 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSPHP1O15172 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PSPHP1O15172 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PSPHP1O15172 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PSPHP1O15172 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PSPHP1O15172 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PSPHP1O15172 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PSPHP1O15172 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PSPHP1O15172 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PSPHP1O15172 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PSPHP1O15172 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PSPHP1O15172 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PSPHP1O15172 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PSPHP1O15172 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PSPHP1O15172 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSPHP1O15172 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSPHP1O15172 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PSPHP1O15172 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSPHP1O15172 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSPHP1O15172 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PSPHP1O15172 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSPHP1O15172 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PSPHP1O15172 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PSPHP1O15172 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PSPHP1O15172 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSPHP1O15172 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSPHP1O15172 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSPHP1O15172 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSPHP1O15172 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms