Protein–RNA interactions for Protein: O14717

TRDMT1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1O14717 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TRDMT1O14717 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TRDMT1O14717 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDMT1O14717 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRDMT1O14717 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TRDMT1O14717 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
TRDMT1O14717 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
TRDMT1O14717 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRDMT1O14717 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
TRDMT1O14717 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TRDMT1O14717 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TRDMT1O14717 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRDMT1O14717 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TRDMT1O14717 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TRDMT1O14717 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TRDMT1O14717 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRDMT1O14717 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TRDMT1O14717 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TRDMT1O14717 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TRDMT1O14717 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRDMT1O14717 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDMT1O14717 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRDMT1O14717 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRDMT1O14717 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRDMT1O14717 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TRDMT1O14717 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRDMT1O14717 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRDMT1O14717 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRDMT1O14717 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRDMT1O14717 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRDMT1O14717 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRDMT1O14717 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRDMT1O14717 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRDMT1O14717 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRDMT1O14717 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRDMT1O14717 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRDMT1O14717 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRDMT1O14717 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRDMT1O14717 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRDMT1O14717 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TRDMT1O14717 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TRDMT1O14717 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRDMT1O14717 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRDMT1O14717 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRDMT1O14717 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRDMT1O14717 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRDMT1O14717 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDMT1O14717 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRDMT1O14717 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRDMT1O14717 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRDMT1O14717 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRDMT1O14717 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRDMT1O14717 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRDMT1O14717 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRDMT1O14717 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRDMT1O14717 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRDMT1O14717 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRDMT1O14717 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDMT1O14717 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRDMT1O14717 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRDMT1O14717 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRDMT1O14717 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRDMT1O14717 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TRDMT1O14717 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRDMT1O14717 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDMT1O14717 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDMT1O14717 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDMT1O14717 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TRDMT1O14717 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDMT1O14717 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDMT1O14717 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRDMT1O14717 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRDMT1O14717 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRDMT1O14717 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms