Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EBAG9O00559 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EBAG9O00559 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EBAG9O00559 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EBAG9O00559 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EBAG9O00559 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EBAG9O00559 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EBAG9O00559 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
EBAG9O00559 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
EBAG9O00559 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
EBAG9O00559 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EBAG9O00559 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
EBAG9O00559 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
EBAG9O00559 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
EBAG9O00559 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
EBAG9O00559 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EBAG9O00559 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
EBAG9O00559 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
EBAG9O00559 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
EBAG9O00559 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
EBAG9O00559 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
EBAG9O00559 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EBAG9O00559 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EBAG9O00559 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
EBAG9O00559 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
EBAG9O00559 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
EBAG9O00559 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EBAG9O00559 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EBAG9O00559 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EBAG9O00559 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EBAG9O00559 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EBAG9O00559 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EBAG9O00559 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EBAG9O00559 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EBAG9O00559 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EBAG9O00559 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EBAG9O00559 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EBAG9O00559 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EBAG9O00559 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EBAG9O00559 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EBAG9O00559 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EBAG9O00559 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EBAG9O00559 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EBAG9O00559 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EBAG9O00559 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
EBAG9O00559 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
EBAG9O00559 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EBAG9O00559 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EBAG9O00559 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
EBAG9O00559 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
EBAG9O00559 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
EBAG9O00559 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
EBAG9O00559 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
EBAG9O00559 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
EBAG9O00559 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EBAG9O00559 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EBAG9O00559 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EBAG9O00559 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EBAG9O00559 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EBAG9O00559 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
EBAG9O00559 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EBAG9O00559 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EBAG9O00559 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EBAG9O00559 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EBAG9O00559 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EBAG9O00559 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EBAG9O00559 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EBAG9O00559 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EBAG9O00559 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBAG9O00559 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EBAG9O00559 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EBAG9O00559 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EBAG9O00559 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
EBAG9O00559 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EBAG9O00559 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EBAG9O00559 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EBAG9O00559 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EBAG9O00559 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EBAG9O00559 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EBAG9O00559 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EBAG9O00559 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EBAG9O00559 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms