Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT5O00445 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT5O00445 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT5O00445 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT5O00445 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT5O00445 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT5O00445 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT5O00445 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT5O00445 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT5O00445 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT5O00445 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SYT5O00445 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT5O00445 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SYT5O00445 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SYT5O00445 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SYT5O00445 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT5O00445 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SYT5O00445 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SYT5O00445 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SYT5O00445 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SYT5O00445 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SYT5O00445 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT5O00445 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SYT5O00445 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYT5O00445 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT5O00445 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYT5O00445 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYT5O00445 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT5O00445 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYT5O00445 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYT5O00445 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT5O00445 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT5O00445 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYT5O00445 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYT5O00445 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT5O00445 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYT5O00445 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT5O00445 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYT5O00445 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT5O00445 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYT5O00445 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYT5O00445 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT5O00445 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT5O00445 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYT5O00445 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYT5O00445 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYT5O00445 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYT5O00445 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYT5O00445 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYT5O00445 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT5O00445 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYT5O00445 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT5O00445 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT5O00445 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYT5O00445 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT5O00445 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYT5O00445 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYT5O00445 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYT5O00445 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT5O00445 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYT5O00445 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYT5O00445 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT5O00445 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYT5O00445 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT5O00445 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYT5O00445 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYT5O00445 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYT5O00445 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT5O00445 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT5O00445 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYT5O00445 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT5O00445 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYT5O00445 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT5O00445 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYT5O00445 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYT5O00445 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT5O00445 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT5O00445 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYT5O00445 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT5O00445 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYT5O00445 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT5O00445 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYT5O00445 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT5O00445 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYT5O00445 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYT5O00445 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYT5O00445 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT5O00445 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SYT5O00445 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYT5O00445 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT5O00445 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYT5O00445 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYT5O00445 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYT5O00445 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYT5O00445 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT5O00445 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT5O00445 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYT5O00445 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYT5O00445 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYT5O00445 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms