Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCDC179H3BU77 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC179H3BU77 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC179H3BU77 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC179H3BU77 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC179H3BU77 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC179H3BU77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC179H3BU77 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC179H3BU77 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC179H3BU77 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC179H3BU77 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC179H3BU77 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC179H3BU77 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC179H3BU77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC179H3BU77 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC179H3BU77 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC179H3BU77 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC179H3BU77 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC179H3BU77 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CCDC179H3BU77 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC179H3BU77 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC179H3BU77 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CCDC179H3BU77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC179H3BU77 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CCDC179H3BU77 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
CCDC179H3BU77 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms