Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF879B4DU55 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF879B4DU55 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF879B4DU55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF879B4DU55 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF879B4DU55 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF879B4DU55 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF879B4DU55 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF879B4DU55 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF879B4DU55 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF879B4DU55 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF879B4DU55 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF879B4DU55 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF879B4DU55 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF879B4DU55 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF879B4DU55 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF879B4DU55 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF879B4DU55 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF879B4DU55 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZNF879B4DU55 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF879B4DU55 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF879B4DU55 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF879B4DU55 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF879B4DU55 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF879B4DU55 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF879B4DU55 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF879B4DU55 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZNF879B4DU55 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF879B4DU55 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF879B4DU55 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF879B4DU55 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF879B4DU55 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNF879B4DU55 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF879B4DU55 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF879B4DU55 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms