Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
B4DEV8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
B4DEV8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B4DEV8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DEV8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
B4DEV8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B4DEV8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B4DEV8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DEV8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B4DEV8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DEV8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
B4DEV8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
B4DEV8 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DEV8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
B4DEV8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DEV8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B4DEV8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
B4DEV8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B4DEV8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B4DEV8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DEV8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
B4DEV8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B4DEV8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
B4DEV8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DEV8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B4DEV8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B4DEV8 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
B4DEV8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DEV8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
B4DEV8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B4DEV8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B4DEV8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B4DEV8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DEV8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B4DEV8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B4DEV8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B4DEV8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DEV8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B4DEV8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DEV8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DEV8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B4DEV8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DEV8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B4DEV8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DEV8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DEV8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B4DEV8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B4DEV8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
B4DEV8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DEV8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DEV8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B4DEV8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DEV8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B4DEV8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
B4DEV8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DEV8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B4DEV8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
B4DEV8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B4DEV8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
B4DEV8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DEV8 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DEV8 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B4DEV8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B4DEV8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DEV8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B4DEV8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B4DEV8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B4DEV8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B4DEV8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B4DEV8 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B4DEV8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
B4DEV8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B4DEV8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DEV8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B4DEV8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DEV8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DEV8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
B4DEV8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DEV8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DEV8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B4DEV8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DEV8 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
B4DEV8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DEV8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DEV8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DEV8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DEV8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B4DEV8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DEV8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DEV8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DEV8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
B4DEV8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B4DEV8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
B4DEV8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DEV8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DEV8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B4DEV8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DEV8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DEV8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
B4DEV8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms