Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IDSB3KWA1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IDSB3KWA1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IDSB3KWA1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IDSB3KWA1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
IDSB3KWA1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IDSB3KWA1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IDSB3KWA1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IDSB3KWA1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IDSB3KWA1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
IDSB3KWA1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IDSB3KWA1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IDSB3KWA1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IDSB3KWA1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IDSB3KWA1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IDSB3KWA1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IDSB3KWA1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IDSB3KWA1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IDSB3KWA1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
IDSB3KWA1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
IDSB3KWA1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IDSB3KWA1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IDSB3KWA1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IDSB3KWA1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IDSB3KWA1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IDSB3KWA1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
IDSB3KWA1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IDSB3KWA1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
IDSB3KWA1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IDSB3KWA1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IDSB3KWA1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IDSB3KWA1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IDSB3KWA1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IDSB3KWA1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IDSB3KWA1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IDSB3KWA1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IDSB3KWA1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
IDSB3KWA1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
IDSB3KWA1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
IDSB3KWA1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IDSB3KWA1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IDSB3KWA1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IDSB3KWA1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IDSB3KWA1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IDSB3KWA1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IDSB3KWA1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IDSB3KWA1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IDSB3KWA1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IDSB3KWA1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IDSB3KWA1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IDSB3KWA1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IDSB3KWA1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IDSB3KWA1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IDSB3KWA1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IDSB3KWA1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IDSB3KWA1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IDSB3KWA1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IDSB3KWA1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IDSB3KWA1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
IDSB3KWA1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IDSB3KWA1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
IDSB3KWA1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IDSB3KWA1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IDSB3KWA1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
IDSB3KWA1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
IDSB3KWA1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
IDSB3KWA1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
IDSB3KWA1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
IDSB3KWA1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms